Localizado no Hospital Veterinário, nessas instalações são realizados o atendimento clínico Médico Veterinário a animais de companhia, principalmente cães e gatos da comunidade de Viçosa, Maceió, Arapiraca e regiões; atende casos encaminhados por colegas médicos veterinários externos, são realizadas aulas práticas e procedimentos de projetos de pesquisas da instituição, além de auxiliar na formação de estagiários e monitores que acompanham os procedimentos realizados nestes locais. No ambulatório de pequenos animais são realizadas as consultas médicas, procedimentos de diagnósticos (exame físico, coleta de material biológico, eletrocardiograma, ultrassonografias), terapêuticos (aplicação de medicamentos).

O ambulatório tem como perspectiva ampliar o atendimento de clínicos para que a casuística possa fornecer informações para projetos de pesquisa e relatos de casos clínicos para os setores de clínica, cirurgia, imagens, patologia clínica, reprodução e patologia médica.

O canil e gatil de pequenos animais estão localizados no Hospital Veterinário do curso de Medicina Veterinária, sendo realizados o internamento de a animais de companhia que após consulta médica ou cirúrgica foram considerados inaptos para receberem alta hospitalar, onde os animais são internados para tratamento intensivo, acompanhamento terapêutico e recuperação pós cirúrgica, como o devido acompanhamento clinico.